Citation: Chen T. et al. ImageGP: An easy-to-use data visualization web server for scientific researchers. iMeta 1: e5.
2. 遇到问题请先检查数据格式和必选参数是否正确,若仍有问题,请在 Feedback反馈页面 输入您的部分数据、选择的参数和出错信息,我们会及时跟您联系解决。
2. Long format数据矩阵需要必选参数 (variable),参数一般为 列的名字 ,用于指定那一列在绘图时作为横轴 (X-axis)、纵轴(数据轴)、亚组轴 (legend)
3. variable的地方输入的是列的名字,大小写敏感
常见错误
Error: unexpected numeric constant in: "if (0 != 0){ data_m$0.2" Execution halted 列名字不能为数字或者以数字开头
Error in read.table(file = "1509195237.txt", : duplicate 'row.names' are not allowed Execution halted 请对给定数据矩阵第一列的重复元素进行预处理,一般可以增加序号进行区分或重复的属性合并
Error in scan(file = file, what = what, sep = sep, quote = quote, dec = dec, : line 1 did not have 3 elements Calls: read.table -> scan Execution halted 请确认矩阵每一行列数是否相同,注意列分隔符是否为TAB键
Error in read.table(file = "/var/www/html/ImageGP/Public/source/lines/1510560834.txt", : more columns than column names Execution halted 请确认矩阵每一行列数是否相同,注意列分隔符是否为TAB键
Error in `$<-.data.frame`(`*tmp*`, variable, value = integer(0)) : replacement has 0 rows, data has 58 Calls: $<- -> $<-.data.frame Execution halted 检查给定的变量名字(也就是列名字)是否存在
Error in `levels<-`(`*tmp*`, value = if (nl == nL) as.character(labels) else paste0(labels, : factor level [4] is duplicated Calls: factor Execution halted 输入的variable order 有重复元素;variable order为对应列的唯一元素的有序排列
Warning message: NAs introduced by coercion Error: Discrete value supplied to continuous scale Execution halted 数据是离散的(discrete, 字符型)却选择了continuous类型 (数值型)
Error in Math.factor(data$GeneRatio) : 'log10' not meaningful for factors Execution halted 请确认指定使用对数处理的列是不是只含有数字
Error in order(NULL, c(6L, 2L, 2L, 6L, 7L, 7L, 6L, 3L, 5L, 4L, 1L, 4L), : argument 1 is not a vector Calls: [ -> [.data.frame -> order -> do.call -> order Execution halted 请提供合法的列名字
Error in log10(data$Pvalue) : non-numeric argument to mathematical function Execution halted 请确认给定的列为数值列
Error: unexpected symbol in "uwid = 70cm" Execution halted 请不用填写单位
Error in fix.by(by.x, x) : 'by' must specify a uniquely valid column Calls: merge -> merge.data.frame -> fix.by Execution halted 请检查输入数据格式
Error: object 'Value' not found Execution halted 请提供数据中存在的列名字,注意大小写;特殊地,对线图,数值列的列名字必须是value
Error in order(data$term, data$Ratio) : argument 1 is not a vector Calls: [ -> [.data.frame -> order Execution halted 请提供数据中存在的列名字,注意大小写;
Error in grDevices::col2rgb(colors, alpha = alpha) : invalid color name 'gree' Calls: scale_colour_gradient ... seq_gradient_pal -> gradient_n_pal -> colour_ramp -> <Anonymous> Execution halted 请提供正确的颜色名字, green不是gree
Error in colSums(temp_data) : 'x' must be an array of at least two dimensions Calls: upset -> FindMostFreq -> colSums Execution halted UpSetView 需要至少3列 (Wide format)
Error in max(sapply(as.vector(unique(data_m$qvalue)), nchar)) : invalid 'type' (list) of argument Execution halted 请确认给定的列 (variable)是否正确。
Error in if (-90 ~ 90 != 0) { : argument is not interpretable as logical In addition: Warning message: In if (-90 ~ 90 != 0) { : the condition has length > 1 and only the first element will be used Execution halted 角度只需给一个数字就可以。没有参数接受一个范围值,范围只用于提示。
Error in hclust(d, method = method) : NA/NaN/Inf in foreign function call (arg 11) Calls: pheatmap -> cluster_mat -> hclust Execution halted 热图层级聚类分析时不允许NA值的存在。
Error: unexpected symbol in "ann_colors = list(Type=c(Pain and" Execution halted 热图自定义注释颜色格式不对,请参照提示。
Error: cannot allocate vector of size 15.2 Gb Execution halted 热图矩阵太大。
Error in cor(t(mat)) : 'x' must be numeric Calls: pheatmap -> cluster_mat -> as.dist -> cor Execution halted 热图必须是数值矩阵,除第一行和第一列,其它的元素都必须是数值。
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