3 软件安装

3.1 软件安装参考视频

B站软件安装视频 https://www.bilibili.com/video/BV1Qk4y117ZY

1. 扩增子和宏基因组课程，只需要参考<p1, 第一集>视频安装软件。
2. 扩增子课程如果需要安装Qiime2，参考<p2, p3>视频。
3. 转录组课程，只需参考 <p4, p5>视频 （转录组课程自己笔记本只要装好 R 和 Rstudio 就行，其它都可以不用管；Git 用不到，R 包在运行脚本时自动安装）。
4. 每个课程的 QQ 群在能下载课程资料（数据、代码、教案、软件）之外，也会有软件安装视频。
5. 网易云课堂领取的视频中，也会有软件安装指导视频。

3.2 软件安装部分最难的操作

3.2.1 从 QQ 群下载 R 包拷贝安装

Figure 3.1: 按步骤 1, 2, 3获取自己笔记本的 R 包安装路径；按步骤 4 下载解压 QQ 群的 R 包；按步骤 5 拷贝从 QQ 群下载解压的所有 R 包到自己笔记本的 R 包安装路径。注意：拷贝解压要完整，包的数目不要少。

3.2.2 配置正确的 Terminal

Figure 3.2: Mac 无需操作。如果你的 Terminal 与本截图不同（如果文字都是黑色，则是错误的），需要按图中 1-8 步骤处理即可。